Jurnal Farmasi Indonesia merupakan media publikasi berupa jurnal ilmiah mengenai ilmu farmasi yang dikelola oleh Fakultas Farmasi, Universitas Setia Budi Surakarta yang terbit sejak Februari 2004 dan terbit 2 kali dalam setahun yaitu periode bulan Maret dan November. Jurnal Farmasi Indonesia menerima naskah tentang hasil penelitian laboratorium, lapangan, studi kasus, telaah pustaka yang erat kaitannya dengan bidang kefarmasian, kesehatan dan lingkungan hidup. Naskah yang dimuat merupakan hasil seleksi dan disetujui oleh Dewan Redaksi dan belum pernah dimuat di jurnal lain.
Jurnal Farmasi Indonesia pada tahun 2004 - 2016 memiliki alamat website http://farmasiindonesia.setiabudi.ac.id/ , pada tahun 2016 JFI telah menerapkan sistem pengelolaan jurnal berbasis OJS 3.0 dengan alamat website http://ejurnal.setiabudi.ac.id/ojs/index.php/farmasi-indonesia. Mulai Vol 14. No 2 tahun 2017 Jurnal Farmasi Indonesia sudah terakreditasi dengan Sinta Score S3.